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Ebola Virus Computational Resources (EbolaVCR) is the in silico resources developed to facilitate scientific community fighting against deadly virus EBOLA. This server enlists possible vaccine candidates, therapeutic siRNAs and other related resources.
Reference: Dhanda et. al. (2016) A web-based resource for designing therapeutics against Ebola Virus. Sci Rep. 6:24782.
AntigenssGP
StrainEbola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)
Number of strain3
Gene IDgi_10313996
Protein IDNP_066248.1
Mapped EpitopeVisualize
Sequence conservationVisualize Alignment
IDstartPeptideCTLMHC I allelesMHC I allele CountHLA allelesHLA allele Count MHC II allelesMHC II allele CountB cell epitopeInterferon-gamma inducerInterleukin-4 stimulator
24809Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)234 FEVDNLTYV YHLA-A*0201, HLA-A*0205, HLA-A2.1, HLA-B*3701, HLA-B40, HLA-B*4403, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B*5401, HLA-B60, HLA-B61, MHC-Db, MHC-Kk13HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, Mamu-A*019DRB1_0305, DRB1_03092N-0.20
24800Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)225 FGTNETEYL NHLA-A2.1, HLA-B*3902, HLA-B*51, HLA-B*5101, HLA-B*5102, HLA-B*5103, HLA-B*5301, HLA-B*5401, HLA-B60, HLA-B7, MHC-Db revised, MHC-Dd, MHC-Kb13NA0DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_04263N-0.38
24589Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)14 FKRTSFFLW NHLA-A20 Cattle, HLA-B*0702, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B*5401, HLA-B*58016NA0DRB1_0701, DRB1_07032N-0.46
24827Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)252 FLLQLNETI YHLA-A*0201, HLA-A*0205, HLA-A2, HLA-A2.1, HLA-A3, HLA-B*51, HLA-B*5101, HLA-B*5102, HLA-B*5103, HLA-B*5301, HLA-B*5401, HLA-B62, MHC-Db, MHC-Db revised, MHC-Kd, MHC-Kk16HLA-A2, HLA-A11, HLA-A3, HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, Mamu-A*0112DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_07039N-0.22
24602Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)27 FQRTFSIPL YHLA-A*0205, HLA-A2.1, HLA-B*0702, HLA-B*2702, HLA-B*2705, HLA-B*3501, HLA-B*3902, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B*5401, HLA-B60, HLA-B62, HLA-B7, HLA-B8, HLA-Cw*060215HLA-B27, HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, Mamu-A*0110DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_010512N0.41
24613Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)38 IHNSTLQVS NHLA-B*38011NA0DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_11077N-0.03
24600Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)25 ILFQRTFSI YHLA-A*0201, HLA-A*0205, HLA-A2, HLA-A2.1, HLA-A3, HLA-B14, HLA-B*2702, HLA-B*2705, HLA-B*51, HLA-B*5101, HLA-B*5102, HLA-B*5103, HLA-B*5201, HLA-B*5301, HLA-B*5401, HLA-B62, HLA-B8, MHC-Dd, MHC-Kk19HLA-A2, HLA-A*1101, HLA-A3, HLA-A*0301, HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, Mamu-A*01, HLA-A*680114DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_132828N0.31
24760Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)185 ILPQAKKDF NHLA-B*51, HLA-B62, MHC-Ld3NA0DRB1_1102, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_13289N-0.49
24608Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)33 IPLGVIHNS YHLA-B*3501, HLA-B*51, HLA-B*5101, HLA-B*5102, MHC-Ld5HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, Mamu-A*019DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_03114N0.14
24704Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)129 IRGFPRCRY NHLA-B14, HLA-B*2702, HLA-B*2705, HLA-B*51, HLA-Cw*07025NA0DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_150628N0.30
24793Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)218 IRYQATGFG NHLA-B*2702, HLA-B*27052NA0DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0806, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_132829N0.39
24745Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)170 IYRGTTFAE NNA0NA0DRB1_0301, DRB1_13042N-0.10
24645Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)70 LEGNGVATD NNA0NA0DRB1_0806, DRB1_13042N0.99
24686Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)111 LEIKKPDGS NHLA-B40, HLA-B*4403, HLA-B61, MHC-Kk4NA0DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_13227N0.06
24610Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)35 LGVIHNSTL NHLA-B14, HLA-B*3902, HLA-B40, HLA-B*51, HLA-B*5101, HLA-B*5102, HLA-B*5103, HLA-B*5301, HLA-B60, HLA-B7, HLA-Cw*0301, MHC-Db, MHC-Db revised, MHC-Dd, MHC-Kd15NA0DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_15069N0.88
24643Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)68 LNLEGNGVA NHLA-B*51, HLA-B*53012NA0DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_04263N-0.15
24829Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)254 LQLNETIYT NHLA-A*0201, HLA-A*0205, HLA-B*2702, HLA-B624NA0DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_150626N-0.45
24618Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)43 LQVSDVDKL NHLA-A*0201, HLA-A*0205, HLA-A2, HLA-A24, HLA-B14, HLA-B*2702, HLA-B*2705, HLA-B*3901, HLA-B*3902, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B60, HLA-B62, HLA-B7, HLA-Cw*0301, HLA-Cw*0401, MHC-Db revised, MHC-Kd18NA0DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0701, DRB1_07037N-0.60
24638Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)63 LRSVGLNLE NHLA-B*27021NA0DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1304, DRB1_13216N-0.10
24626Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)51 LVCRDKLSS NNA0NA0DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_150636Y-0.89
24596Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)21 LWVIILFQR NHLA-A*3101, HLA-A*33022NA0DRB5_0101, DRB5_01052N-0.99
24623Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)48 VDKLVCRDK NNA0NA0DRB5_0101, DRB5_01052N-0.27
24612Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)37 VIHNSTLQV NHLA-A*0201, HLA-A*0205, HLA-A2, HLA-B*51, HLA-B*5103, HLA-B*53016NA0DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_150626N0.36
24744Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)169 VIYRGTTFA NHLA-A*0201, HLA-A*0205, HLA-A2, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B*54016NA0DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_132210N0.13
24667Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)92 VPPKVVNYE NHLA-B*51, HLA-B*53012NA0DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_13043N-0.96
24654Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)79 VPSATKRWG NHLA-B*511NA0DRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_13283N0.99
24671Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)96 VVNYEAGEW NHLA-B*511NA0DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1501, DRB1_15067N0.11
24863Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)288 WAFWETKKP NHLA-B*51, HLA-B*54012NA0DRB1_04021N-0.17
24807Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)232 YLFEVDNLT NHLA-A*0201, HLA-A*0205, HLA-A2.1, HLA-A3, HLA-B*2702, HLA-B*51, HLA-B*5401, HLA-B628NA0DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_04263N-0.36
24684Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)109 YNLEIKKPD NHLA-B*51, HLA-B*54012NA0DRB1_0801, DRB1_0817, DRB1_13213Y-0.18
24746Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)171 YRGTTFAEG NHLA-B*2702, HLA-B*51, HLA-B*54013NA0DRB1_04211N-0.06
24712Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)137 YVHKVSGTG NHLA-B*51, HLA-B*54012NA0DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_08176N0.99
24816Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)241 YVQLESRFT NHLA-A*0201, HLA-B*51, HLA-B*54013NA0DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0801, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_010518N-0.03
24788Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)213 YYSTTIRYQ NHLA-B*51, HLA-B*54012NA0DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1307, DRB1_13234N0.04